一致性分析判断工具——Kappa(卡方检验)


一、原理
卡方检验是检验实际的分布于理论的分布时候一致的检验,那么用什么统计量来衡量呢!统计学家引入了如下的公式:

Ai为i水平的观察频数,Ei为i水平的期望频数,n为总频数,pi为i水平的期望频率。i水平的期望频数Ti等于总频数n×i水平的期望概率pi,k为单元格数。当n比较大时,χ2统计量近似服从k-1(计算Ei时用到的参数个数)个自由度的卡方分布。和参数检验的判断标准一样,这个统计量有一个相伴概率p。零假设是理论分布与实际分布是一致的,所以如果P小于0.05,那么就拒绝原假设,认为理论和实际分布不一致。

二、卡方检验用途
⑴诊断试验方法和金标准的一致性;
⑵两种检测(诊断)方法对同一样本检测(诊断)的一致性;
⑶同一医务工作者对同一观察对象进行两次观测结果的一致性;
⑷两个或两个以上医务工作者对同一观察对象结果的一致性等。

三、计算
以下以以诊断试剂临床试验为例,简述卡方检验计算过程
⑴ 四格表

⑵ 计算灵敏度和特异性
敏感度(阳性符合率)=a/(a+c)
特异性(阴性符合率)=d/(b+d)

⑶ 计算实际和理论一致率
P0实际一致率(总符合率)= (a+d)/N
Pc理论一致率=[(a+c)(a+b)+(b+d)(c+d)]/ N2

⑷kappa值计算及结果判断
Kappa=(P0-Pc)/(1-Pc)
Kappa一致性检验,取95%可置信区间,Kappa值在0-1之间,越接近1说明两种试剂检测结果的一致性越好,一般Kappa值大于0.75即可认为具有高度一致性。

四、扩展:95%可信区间计算
⑴敏感度(阳性符合率)、特异性(阴性符合率)、实际一致率(总符合率)按下表计算各自Q1、Q2、Q3的值;


⑵敏感度(阳性符合率)、特异性(阴性符合率)、实际一致率(总符合率)95%可信区间计算公式如下:
[(Q1-Q2)/Q3,(Q1+Q2)/Q3]

Kappa计算表格下载

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